Universitas Al Azhar Indonesia memiliki dua program pendidikan, yaitu program sarjana dan pascasarjana. Terdiri dari 6 fakultas yang menyelenggarakan 19 program studi sarjana, 5 program studi magister dan 1 program studi doktoral. Selain itu, UAI juga memiliki kelas blended learning, yaitu kelas yang mengkolaborasikan antara tatap muka dengan online system. Kelas blended ini terdiri dari program studi akuntansi, manajemen, ilmu hukum, informatika, teknik elektro dan teknik industri.